Večina trajnih markerjev, zlasti tistih z naftnimi črnili, je na splošno odporni na vodo in zato manj verjetno zbledi v vodi. Črnila v teh označevalcih so zasnovana tako, da ustvarjajo dolgotrajne, ne-označevalne znamke na različnih površinah, vključno z ohranjanjem dobre barvne stabilnosti v vlažnih okoljih.
Pomembno pa je opozoriti, da imajo lahko tudi trajni markerji različne lastnosti odpornosti na vodo, odvisno od blagovne znamke, modela in formulacije črnila. Nekatere blagovne znamke markerjev imajo lahko močnejšo odpornost na vodo in lahko vzdržujejo barvo pod vodo, medtem ko imajo druge le zmerno odpornost na vodo in lahko zbledijo ali odpadejo v velikih količinah vode.
Poleg tega lahko celo označevalci z dobro vodoodpornostjo zbledijo ali zabrišejo, če je marker dlje časa potopljen v vodo ali je podvržen močnemu pretoku vode. Zato je pri uporabi trajnih označevalcev za označevanje treba izbrati ustrezno blagovno znamko in model v skladu s posebnim okoljem uporabe in potrebe, da zagotovita, da lahko njegova vodna odpornost in trajnost ustrezata zahtevam.
Čeprav so trajni markerji na splošno odporni na vodo, je zbledelo v vodi odvisno od različnih dejavnikov, vključno z blagovno znamko, modelom, formulacijo črnila in uporabo okolja in pogojev. Zato je, ko je potrebno vodoodporno označevanje, priporočljivo izvesti test na majhnem območju ali poiskati strokovni nasvet.
